Naukowcy pracują nad ochroną żyjących drzew kopalnianych na Fiji przed zmianami klimatycznymi stosując technikę sekwencjonowania DNA (technika odczytywania sekwencji, czyli kolejności par nukleotydowych w cząsteczce DNA). Doktor Peter Prentis z Queensland University of Technology, powiedział, że wyniki pozwolą naukowcom zrozumieć w jaki sposób jest generowana różnorodność biologiczna. “Fiji jest istotnym miejscem w różnorodności biologicznej. Większość gatunków zwierząt spotykanych na Fiji nie pojawia się nigdzie indziej na świecie”, mówi Prentis. “Mój projekt bada jak powstały te wyspiarskie gatunki wśród tych starożytnych drzew”.
Doktor Prentis zamierza użyć wartego 150,000 dolarów techniki sekwencjonowania DNA, zwanego Jonowym Potokiem (jonowe półprzewodnikowe sekwencjonowanie), aby wskazać geny trzech gatunków drzew: Cynometra falcata (rodzaj drzewa z rodziny bobowaych – krytycznie zagrożony), Cynometra insularis (występujący jedynie an Fiji) oraz Degeneria vitiense (chronione), Degeneria Roseiflora i Podocarpus affinis (zagrożone) oraz Podocarpus neriifolius (rodzaj drzew iglastych).
Dr Prentis powiedział, że naukowcy będą porównywać zagrożone lub chronione gatunki drzew z tymi bardziej powszechnie występującymi na Fiji. “Będziemy analizować każdą parę gatunków, aby znaleźć geny, które odgrywały znaczące role w procesie tworzenia unikalnych drzew. Jesteśmy bardzo zainteresowani jak te rzadkie drzewa ewoluują”, powiedział. Dodał również, że powinni również przewidzieć jak drzewa zaadaptują się do zmian klimatycznych.
“Potrzebujemy zrozumieć najpierw jak bioróżnorodność jest tworzona, aby móc zrozumieć w jaki najlepszy sposób ją chronić w przyszłości. Wraz ze zmianami klimatycznymi te gatunki będą musiały odpowiedzieć na wzrastające zmiany i warunki środowiskowe, jak równiez wzrost ekstremalnych wydarzeń jak cyklony. Nie wiemy czy żyjące drzewa kopalniane mają potencjał, aby dostosować się do nadchodzącego środowiska”, wyjaśnia Prentis.
Wspomniana nowa technologia Ion Torrent przyspieszy badania prowadzone na Queensland University of Technology, pozwalając naukowcom na analizę dzisiątek tysięcy genów w tym samym czasie, w porównaniu do studiowaniu garści genów jednocześnie z uzyciem standardowego sekwencera DNA. “To co możemy zrobić w kilka godzin pracując z Ion Torrentem, jest równoważne pracy 6 miesięcy standardowego sekwencera DNA”.
Ion Torrent, który może sprawdzać sekwencje całych genomów mikroorganizmów oraz określonych genów u gatunków takich jak ludzie, insekty czy rośliny, będzie używany do ochrony zdrowia, rolnictwa, a także badań ewolucyjnych.
Badania doktora Prentisa, prowadzone wraz z doktorem Gunnarem Keppelem z Curtin University w zachodniej Australii, utrzymały fundusz 40,000 dolarów z Australian Pacific Sciences Foundation.
Źródło: Australia Journal of Botany, Queensland University of Technology Grafika: Illinois State Geological Survey
